YOLOvME:菌落计数、涂片评估与野生动物检测
了解 Martin Schätz 如何运用 YOLOv5,高效开展传染病研究中的图像分析、菌落计数和野生动物监测。
Nuvola Ladi3 分钟阅读
你是否曾经需要评估大量图像、数据、结果等?更复杂的是,你是否还得手动完成这些评估?这当然会耗费大量时间。
对 Martin Schätz 来说,Ultralytics YOLOv5是一个实用工具,帮助他缩短了传染病研究和监测中图像分析所需的时间。Martin 身兼数职,但他的工作核心是生物图像分析;他将这个领域称为“计算机科学与生物学的交汇点”。我们想进一步了解 Martin 在菌落监测和计数方面的工作,于是与他进行了交谈。
你具体用 Ultralytics YOLOv5 做什么?#
Martin 在项目中采用 Ultralytics YOLOv5,源于他希望将现有的目标检测、分类和计数流程自动化。他还计划在长期演化实验等场景中使用 YOLOv5。

细菌菌落计数#
在实验室中,技术人员通常会在琼脂平板上对培养出的细菌菌落进行人工计数。遗憾的是,人工计数容易出错。为解决这一问题,Martin 使用 Ultralytics YOLOv5 实现计数流程自动化。这种方法大幅减少了菌落检测和分类过程中的错误,也缩短了所需时间。
显微物体检测与分类#
要在微观世界中进行测试,就必须评估涂片。这项工作目前仍主要依靠人工完成。众所周知,人工流程更容易出现错误,结果也更不稳定。此外,虽然已有用于检测特定形状物体的合适工具,但自动计数和分类各种物体仍需要更专业的工具。

野生动物检测与监测#
“我的同事会记录森林和其他地点的野生动物,通常要手动查看视频,也就是说,他们得坐下来逐一查看数百个视频。”
考虑到在视频中手动寻找野猪或鹿可能耗费极长时间,Martin 深知目标检测一定能优化这一流程。在这里,他们采用了 Ultralytics YOLOv5,让动物进入摄像头视野时就能轻松、即时地检测到野生动物。

你是如何进入机器学习和视觉 AI 领域的?#
攻读硕士学位时,Martin 研究了他所说的“传统图像分析方法”。在他即将完成学位时,深度学习逐渐受到越来越多的关注;当时,人们只称之为“卷积网络”。
那段时间,Martin 在处理数据挖掘工作,但这些数据并不太实用。Martin 希望亲自处理数据,于是决定投身机器学习和视觉 AI 领域。
对于想开始使用 Ultralytics YOLOv5 的人,你有什么建议?#
目前,学习机器学习和视觉 AI 的过程可能相当复杂。作为一名使用视觉 AI 多年的从业者,Martin 为所有想要入门的人提出了三点建议:
- “作为一名科学家,我喜欢先把所有内容读一遍,这样遇到第一次没完全理解的部分时,就能再读一遍。”在开始训练模型之前先打好基础,会让初学者更容易完成整个过程。
- 此外,Martin 还提到了研究他人应用案例的价值。看看其他人在做什么,能为你的用途和项目带来灵感。
- 反复运行并测试你的项目。如果发现需要修改某些内容,就回头进行修改,然后继续推进,开展更多测试和迭代。
Martin Schätz 是一名研究人员,也从事教学工作,专注于生物图像分析和共聚焦显微镜数据处理。Martin 开展该项目的初衷,是优化传染病研究和监测中的图像分析流程。你可以在他的 GitHub 代码库中找到关于 Martin 三个项目的文档和详细信息。此外,Martin 还是 NEUBIAS 的成员。该组织致力于推广生物学/显微镜科学图像分析中最常用的工具,包括模型库中的这些已训练深度学习模型。
我们也想重点介绍你的 YOLOv5 应用案例!在社交媒体上标记 @Ultralytics 并添加 #YOLOvME,就有机会获得专题介绍。
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