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A Theia Scientific redefine a análise de dados de microscopia com os modelos Ultralytics YOLO

Problema

A Theia Scientific propôs-se encontrar um modelo de IA de visão que melhorasse a velocidade, a precisão e a reprodutibilidade da análise de imagens de microscopia.

Solução

Ao integrar os modelos Ultralytics YOLO na sua plataforma, a Theia Scientific transformou a forma como os dados de microscopia são processados, tornando a análise mais eficiente e fiável.

A investigação científica em domínios como a ciência dos materiais e a nanotecnologia depende frequentemente da microscopia de partículas carregadas, da sonda de varrimento e da microscopia ótica para explorar estruturas invisíveis ao olho humano. Por exemplo, a microscopia eletrónica de transmissão (TEM) é uma ferramenta fundamental, capaz de captar detalhes finos à escala nano e atómica.

Infelizmente, uma vez adquiridas estas imagens, a sua análise pode ser lenta e complexa, exigindo frequentemente um esforço manual significativo e conhecimentos especializados. Para melhorar este processo, a Theia Scientific desenvolveu a plataforma Theiascope™, um sistema de análise de imagens de microscopia em tempo real que integra os modelos Ultralytics YOLO para automatizar a deteção de imagens, a segmentação e as medições quantitativas, tornando a microscopia mais rápida, mais eficiente e reprodutível.

Explorar o papel da IA de visão na imagiologia científica

Fundada pelos irmãos Kevin e Christopher Field, a Theia Scientific desenvolve ferramentas de software avançadas para acelerar a investigação em microscopia. Com experiência em ciência dos materiais, automação industrial, eletrónica e engenharia de software, concentram-se em reduzir os estrangulamentos que os cientistas, engenheiros e investigadores enfrentam quando analisam dados de imagem complexos. 

O seu principal produto, a plataforma Theiascope™, integra a visão por computador para detetar, segmentar e medir automaticamente caraterísticas em imagens de microscopia eletrónica. Ao confiar na Vision AI em vez de anotação e rastreamento manual, a plataforma fornece resultados consistentes e reproduzíveis.

Porque é que as imagens de microscopia são difíceis de analisar manualmente?

As imagens de microscopia, especialmente as captadas com TEM, são muito pormenorizadas mas difíceis de interpretar. Cada imagem contém centenas a milhares de caraterísticas e estruturas finas, como grãos e limites, que têm de ser cuidadosamente identificadas, anotadas, traçadas e/ou medidas para extrair dados significativos. Tradicionalmente, isto tem sido feito à mão, o que é lento e pode variar de pessoa para pessoa. Dois investigadores podem anotar a mesma imagem de forma diferente, conduzindo a resultados inconsistentes e a grandes barras de erro.

Este processo torna-se ainda mais complexo quando estão em causa grandes conjuntos de dados. Para obter informações fiáveis, é frequentemente necessário analisar milhares de imagens, o que pode demorar semanas ou mesmo meses utilizando métodos manuais. Para além disso, as variações de contraste, o ruído e a sobreposição de estruturas tornam o processo ainda mais difícil.

Para os investigadores que pretendem estudar a evolução microestrutural ou seguir as alterações ao longo do tempo, estes problemas podem atrasar a investigação. A Theia Scientific reconheceu que estas preocupações exigiam uma solução mais automatizada e fiável.

Melhorar os fluxos de trabalho de microscopia utilizando os modelos YOLO da Ultralytics

Depois de explorar diferentes abordagens para automatizar a análise de dados de microscopia, a Theia Scientific viu que os modelos Ultralytics YOLO ofereciam a velocidade, a precisão e a flexibilidade necessárias para a análise de imagens de microscopia em tempo real, permitindo resultados quantitativos instantâneos no microscópio enquanto as experiências ainda estão em curso. Os modelos Ultralytics YOLO, como o Ultralytics YOLO11 e o Ultralytics YOLOv8, suportam tarefas de visão por computador, como a deteção de objectos (identificação e localização de caraterísticas individuais numa imagem) e a segmentação de instâncias (delineamento de cada caraterística ao nível do pixel). Estas tarefas permitem detetar estruturas à escala nanométrica, como grãos e limites, diretamente nas imagens TEM à medida que são captadas.

Fig. 1. Fluxo de trabalho atual de análise de dados e imagens de microscopia. Os cientistas, engenheiros e investigadores procuram, em última análise, descobertas e respostas no final do fluxo de trabalho. Entretanto, o fluxo de trabalho é desarticulado e trabalhoso, com o tempo/trabalho relativo necessário para cada passo apresentado na parte inferior. A deteção e a agregação de caraterísticas são as fases mais demoradas do fluxo de trabalho. As setas cinzentas que conduzem de volta à aquisição representam a necessidade de readquirir dados porque os dados actuais não são úteis. Fonte: Theia Scientific.

Por exemplo, num estudo recente sobre películas finas policristalinas, os modelos Theiascope™ e Ultralytics YOLO foram utilizados para identificar e medir estruturas de grão que influenciam as propriedades dos materiais utilizados em eletrónica, revestimentos e dispositivos de energia. As distribuições exactas do tamanho do grão são essenciais para compreender como estas películas evoluem durante as experiências. 

Uma das principais razões pelas quais os modelos YOLO da Ultralytics são tão eficazes nestes casos de utilização é a sua capacidade de interpolação em grandes conjuntos de dados. Em vez de exigir que todos os fotogramas de uma experiência sejam etiquetados, os investigadores podem anotar apenas uma pequena fração das imagens, treinar um modelo YOLO e, em seguida, deixá-lo analisar de forma fiável milhares de fotogramas adicionais. Isto torna possível seguir o crescimento do grão e as alterações dos limites em experiências TEM de lapso de tempo com um mínimo de intervenção manual.

Porquê escolher os modelos Ultralytics YOLO?

No estudo sobre películas finas policristalinas referido anteriormente, verificou-se que o Ultralytics YOLOv8 era até 43 vezes mais rápido do que o U-Net (um modelo frequentemente utilizado para análise de imagens científicas). Esta velocidade torna o YOLO prático para a análise em tempo real, no microscópio. 

Enquanto a U-Net é exacta mas lenta, a YOLO combina velocidade com precisão, fazendo corresponder as medições de tamanho de grão a 3% da verdade terrestre. A sua conceção também o torna mais flexível, lidando facilmente com diferentes escalas e configurações de treino. Para os investigadores, isto significa resultados mais rápidos sem sacrificar a fiabilidade, o que é ideal para acelerar os fluxos de trabalho de microscopia.

Fig. 2. Em comparação com o traçado manual (b) e a U-Net (c), a segmentação YOLOv8 (d) fornece contornos mais nítidos e precisos em imagens de microscopia.(Fonte)

Reduzir a distorção e aumentar a consistência na microscopia com YOLO

Através da plataforma Theiascope™, a Theia Scientific mostrou que os modelos Ultralytics YOLO podem acelerar a análise de imagens de microscopia e as experiências de TEM, ao mesmo tempo que apoiam a investigação reprodutível a longo prazo. A plataforma foi projetada para ser agnóstica em relação ao microscópio, o que significa que os modelos YOLO são usados para analisar imagens coletadas de diferentes instrumentos sem exigir pipelines personalizados. Esta flexibilidade garante que os fluxos de trabalho permaneçam consistentes em experiências, operadores e ambientes variados.

A reprodutibilidade é outro resultado fundamental. A investigação científica exige frequentemente que os resultados sejam revisitados e validados anos mais tarde. Com vários modelos YOLO integrados no Theiascope™, os investigadores podem executar novamente modelos mais antigos, como o Ultralytics YOLOv5, em conjuntos de dados arquivados e obter resultados consistentes, comparando-os depois diretamente com os resultados de modelos mais recentes, como o Ultralytics YOLO11. Isto torna a verificação dos resultados simples, mesmo com a evolução dos métodos de IA.

Fig. 3. A plataforma Theiascope™. As imagens de microscopia eletrónica são capturadas e transmitidas do computador de aquisição para um dispositivo com GPU que executa uma aplicação Web, uma base de dados de séries temporais e os modelos Ultralytics YOLO. As actualizações e os novos modelos Ultralytics YOLO podem ser enviados para a plataforma com actualizações OTA. Fonte: Theia Scientific.

Além disso, os modelos YOLO da Ultralytics conferem à plataforma a escalabilidade necessária para lidar com grandes conjuntos de dados. As suas capacidades de inferência em tempo real permitem que milhares de imagens TEM sejam analisadas no tempo que seria necessário para analisar manualmente apenas algumas. Isto permite aos investigadores seguir processos dinâmicos, como o crescimento de grãos, ao longo de experiências inteiras, gerando novos conhecimentos e desbloqueando experiências inovadoras à escala e à velocidade necessárias para a investigação de ponta.

Integrar a IA de visão avançada nas ferramentas de investigação da próxima geração

A Theia Scientific vê os modelos Ultralytics YOLO como uma base para o futuro da microscopia. Ao continuar a aperfeiçoar os métodos de formação e as abordagens de calibração, o seu objetivo é melhorar ainda mais a precisão em todas as escalas e condições experimentais. 

No futuro, a Theia Scientific planeia expandir o Theiascope™ para suportar experiências in-situ mais complexas e conjuntos de dados multimodais. Eles acreditam que é provável que a Vision AI se torne uma parte padrão dos fluxos de trabalho de pesquisa da próxima geração, permitindo descobertas mais rápidas e insights mais profundos em todos os domínios científicos.

Interessado em simplificar os fluxos de trabalho da sua empresa? Consulte o nosso repositório GitHub para saber mais sobre a IA de visão. Explore como os modelos YOLO estão a impulsionar inovações em áreas como a IA nos cuidados de saúde e a visão computacional no retalho. Para pôr mãos à obra com o YOLO, descubra como as nossas opções de licenciamento podem apoiar a sua visão.

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Perguntas mais frequentes

O que são os modelos YOLO da Ultralytics?

Os modelos YOLO da Ultralytics são arquitecturas de visão por computador desenvolvidas para analisar dados visuais de imagens e entradas de vídeo. Estes modelos podem ser treinados para tarefas que incluem a deteção de objectos, a classificação, a estimativa de pose, o seguimento e a segmentação de instâncias:

  • Ultralytics YOLOv5
  • Ultralytics YOLOv8
  • Ultralítico YOLO11

Qual é a diferença entre os modelos Ultralytics YOLO?

O Ultralytics YOLO11 é a versão mais recente dos nossos modelos de Visão Computacional. Tal como as versões anteriores, suporta todas as tarefas de visão computacional que a comunidade de IA de visão adorou no YOLOv8. O novo YOLO11, no entanto, vem com maior desempenho e precisão, tornando-o uma ferramenta poderosa e o aliado perfeito para os desafios da indústria do mundo real.

Que modelo YOLO do Ultralytics devo escolher para o meu projeto?

O modelo que optar por utilizar depende dos requisitos específicos do seu projeto. É fundamental ter em conta factores como o desempenho, a precisão e as necessidades de implementação. Eis uma breve descrição geral:

  • Algumas das principais caraterísticas do Ultralytics YOLOv8:
  1. Maturidade e estabilidade: O YOLOv8 é uma estrutura comprovada e estável com documentação extensa e compatibilidade com versões anteriores do YOLO, tornando-o ideal para integração em fluxos de trabalho existentes.
  2. Facilidade de utilização: Com uma configuração fácil para principiantes e uma instalação simples, o YOLOv8 é perfeito para equipas de todos os níveis.
  3. Custo-eficácia: Requer menos recursos computacionais, o que o torna uma excelente opção para projectos que se preocupam com o orçamento.
  • Algumas das principais caraterísticas do Ultralytics YOLO11:
  1. Maior precisão: O YOLO11 supera o YOLOv8 nos testes de referência, alcançando uma melhor precisão com menos parâmetros.
  2. Funcionalidades avançadas: Suporta tarefas de ponta como estimativa de pose, seguimento de objectos e caixas delimitadoras orientadas (OBB), oferecendo uma versatilidade inigualável.
  3. Eficiência em tempo real: Optimizado para aplicações em tempo real, o YOLO11 proporciona tempos de inferência mais rápidos e destaca-se em dispositivos de ponta e tarefas sensíveis à latência.
  4. Adaptabilidade: Com ampla compatibilidade de hardware, o YOLO11 é adequado para implantação em dispositivos de borda, plataformas de nuvem e GPUs NVIDIA

De que licença necessito?

Os repositórios YOLO do Ultralytics, como o YOLOv5 e o YOLO11, são distribuídos sob a licença AGPL-3.0 por defeito. Esta licença aprovada pela OSI foi concebida para estudantes, investigadores e entusiastas, promovendo a colaboração aberta e exigindo que qualquer software que utilize componentes AGPL-3.0 seja também de fonte aberta. Embora assegure a transparência e promova a inovação, pode não se alinhar com casos de utilização comercial.
Se o seu projeto envolver a incorporação de software Ultralytics e modelos de IA em produtos ou serviços comerciais e pretender contornar os requisitos de código aberto da AGPL-3.0, uma Licença Empresarial é ideal.

‍Os benefíciosda Licença Empresarial incluem:

  • Flexibilidade comercial: Modifique e incorpore o código-fonte e os modelos do Ultralytics YOLO em produtos proprietários sem aderir ao requisito AGPL-3.0 de abrir o código-fonte do seu projeto.
  • Desenvolvimento Proprietário: Obtenha total liberdade para desenvolver e distribuir aplicações comerciais que incluam o código e os modelos do Ultralytics YOLO.

Para garantir uma integração perfeita e evitar as restrições da AGPL-3.0, solicite uma Licença Empresarial Ultralytics usando o formulário fornecido. A nossa equipa ajudá-lo-á a adaptar a licença às suas necessidades específicas.

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