Зелёная проверка
Ссылка копируется в буфер обмена

Исследование применения компьютерного зрения в микробиологии

Узнай, как компьютерное зрение в микробиологии может поддержать точный анализ клеток, эффективный подсчет колоний и улучшить диагностику в исследовательских лабораториях.

Наблюдение - ключевая часть микробиологии, в которой исследователи анализируют клетки под микроскопом, отслеживают колонии бактерий и следят за ростом микроорганизмов. Эти виды наблюдательных задач важны как для исследовательских, так и для диагностических процессов.

Благодаря последним инновациям в области цифровой визуализации и автоматизации, лаборатории теперь получают больше визуальных данных, чем когда-либо прежде. Например, микроскоп высокого разрешения может легко получить тысячи изображений для одного исследования. Каждое изображение содержит мельчайшие и важные детали. 

Однако просматривать их по отдельности может быть медленным и непоследовательным процессом. Такой рост количества данных вызвал потребность в более быстром и надежном анализе изображений. 

Одной из ключевых технологий, помогающих автоматизировать этот процесс, является компьютерное зрение, которое позволяет компьютерам интерпретировать и анализировать визуальную информацию с изображений или видео. В частности, модели искусственного зрения, такие как Ultralytics YOLO11 используются для поддержки микробиологических исследований, классифицируя клетки, подсчитывая колонии бактерий и отслеживая рост микроорганизмов. 

В этой статье мы рассмотрим, как компьютерное зрение в микробиологии улучшает рабочие процессы в лаборатории и позволяет ученым работать более эффективно и последовательно. Давай начнем!

Роль компьютерного зрения в микробиологии

Задачи компьютерного зрения, такие как обнаружение объектов и классификация изображений, с помощью таких моделей, как YOLO11, можно использовать для обнаружения закономерностей, выделения важных особенностей и автоматизации повторяющихся лабораторных задач, которые в противном случае отнимали бы драгоценное время и силы. Прежде чем мы погрузимся в конкретные приложения, давай подробнее рассмотрим, как компьютерное зрение используется в микробиологии.

Классификация клеток с помощью компьютерного зрения

Классификация клеток - одна из самых важных задач, связанных с изображениями, в микробиологии. В лабораториях часто используют окрашенные изображения, чтобы помочь определить типы клеток, обнаружить признаки инфекции и выделить специфические особенности клеток под микроскопом. Ручной просмотр занимает много времени и может быть сложным для масштабирования. Сейчас многие лаборатории используют компьютерное зрение для автоматического обнаружения, сегментирования и классификации клеток, чтобы решить эту проблему.

Например, в университетской больнице Монклендс в Шотландии в рамках пилотной программы использовалось компьютерное зрение для улучшения скрининга рака шейки матки. Образцы, взятые у пациенток с положительным тестом на вирус папилломы человека (ВПЧ), были оцифрованы и обработаны с помощью моделей Vision AI. Система анализировала структуру клеток и отмечала все необычные особенности для рассмотрения медицинским экспертом.

Это помогло команде определить приоритетность образцов с высоким риском на более ранних этапах рабочего процесса. В результате анализ слайдов стал более быстрым и целенаправленным, и они смогли проводить больше скринингов, не меняя процесс подготовки и подачи образцов.

Рис. 1. Классификация клеток с помощью компьютерного зрения может улучшить скрининг шейки матки с помощью ИИ.

Автоматизация подсчета колоний и анализ роста

Подсчет колоний - это лабораторный метод, используемый для измерения роста микроорганизмов и оценки того, как образцы реагируют на лечение. Он широко используется при разработке вакцин, клинических испытаниях и для обеспечения безопасности пищевых продуктов. Процесс подсчета может быть сложным, если он выполняется вручную, особенно когда колонии накладываются друг на друга или увеличивается объем пластины.

Чтобы упростить этот процесс, можно использовать задачи компьютерного зрения, такие как сегментация экземпляров, чтобы очертить границы колоний, измерить их размер и подсчитать каждую колонию на основе ее формы и распространения, даже в случае перекрытия. Это ускорит процесс подсчета и сделает его более последовательным в разных партиях.

Например, международно признанный центр исследования вакцин использует ProtoCOL 3- продвинутый счетчик колоний, работающий на основе компьютерного зрения. Система сканирует многолуночные планшеты и анализирует колонии, которые выживают после воздействия антител. С помощью этой автоматизации предприятие увеличило производительность с анализа 16 планшетов до более чем 300 в день.

Рис. 2. Взгляд на ProtoCOL 3 - пример автоматизации подсчета колоний.

Улучшение изображений при микроскопии с помощью искусственного интеллекта

Микробиологи регулярно используют микроскопы, чтобы наблюдать за структурой и поведением микробных клеток. Однако изображения, полученные с помощью микроскопа, зачастую сложно анализировать из-за перекрывающихся клеток, слабых границ и визуального шума. 

Именно поэтому лаборатории обращаются к инструментам компьютерного зрения, которые повышают четкость изображений, применяя такие техники, как сегментация и шумоподавление, прежде чем обрабатывать их для таких задач, как подсчет колоний или классификация клеток.

Помимо этого, улучшение изображений с помощью ИИ используется для повышения четкости изображений низкого разрешения мелких клеточных структур, таких как митохондрии и ткани мозга. Это позволяет ученым анализировать важные детали в реальном времени, ускоряя исследования и повышая точность диагностики.

Рис. 3. Митохондриальная сеть в раковой клетке, показанная в низком разрешении (слева) и увеличенная с помощью AI (справа).

Применение компьютерного зрения в реальном мире в микробиологии

Теперь, когда мы обсудили, как компьютерное зрение используется в микробиологии, давай погрузимся в некоторые реальные приложения.

Фармацевтические исследования с помощью компьютерного зрения

За любым лекарством, которое мы принимаем, когда плохо себя чувствуем, даже за таким простым, как средство от простуды, стоят огромные усилия. Фармацевтические исследования - это процесс открытия и разработки новых лекарств для лечения болезней, и ключевой частью этого процесса является проверка того, как соединения влияют на микробные клетки. Ученые часто выращивают бактерии на культуральных пластинах, чтобы проверить, может ли лекарство остановить рост микроорганизмов.

Сейчас мы видим, как модели компьютерного зрения, такие как YOLO11 , используются для ускорения анализа культуральных пластин за счет обнаружения объектов. YOLO11 может обнаруживать и подсчитывать клетки, а эти данные, в свою очередь, можно использовать для отслеживания их роста или уменьшения в ответ на лечение, что делает процесс исследования быстрее и эффективнее.

Рис. 4. Пример использования YOLO11 для обнаружения клеток.

Клиническая диагностика с помощью зрения

В то время как фармацевтические исследования занимаются открытием и тестированием новых лекарств, диагностические лаборатории сосредоточены на анализе биологических образцов, таких как кровь, для выявления признаков инфекции или заболевания. Цель диагностических лабораторий - предоставлять точную и своевременную информацию, которая помогает диагностировать состояния, следить за развитием болезни и принимать решения о лечении.

Хотя основные выводы из этих анализов могут отличаться, сами исследования довольно схожи, поэтому компьютерное зрение также играет важную роль в этой области. Например, в анализе крови компьютерное зрение можно использовать для автоматической классификации клеток крови, таких как эритроциты, лейкоциты и тромбоциты. 

Применяя классификацию изображений и обнаружение объектов, модели ИИ Vision могут точно обнаружить и классифицировать эти клетки, упрощая процесс рассмотрения и помогая исследователям или клиницистам сосредоточиться на областях, требующих немедленного внимания.

Рис. 5. Использование компьютерного зрения для обнаружения клеток крови.

Плюсы и минусы компьютерного зрения в микробиологии

Компьютерное зрение позволяет микробиологическим лабораториям оптимизировать задачи, основанные на изображениях, повышая эффективность и согласованность. Оно ускоряет анализ, сокращает ручной труд и повышает повторяемость всех процессов. Вот еще несколько ключевых преимуществ использования компьютерного зрения в микробиологии:

  • Экономическая эффективность: Автоматизация анализа изображений уменьшает потребность в дополнительном персонале, снижая затраты на оплату труда и одновременно повышая производительность.

  • Меньше ошибок при ручном управлении: Уменьшается количество визуальных ошибок и непоследовательных наблюдений, так как модели применяют одни и те же правила для каждого изображения.

  • Поддерживает удаленное использование и работу в режиме реального времени: Изображения можно обрабатывать и просматривать из разных мест. Это помогает исследователям сотрудничать или следить за данными в режиме реального времени.

  • Масштабируемость: По мере увеличения объемов данных системы компьютерного зрения могут легко масштабироваться для работы с большими наборами данных, не требуя пропорционального увеличения трудозатрат и ресурсов.

Несмотря на эти преимущества, есть и несколько ограничений, которые нужно учитывать. Чтобы максимально эффективно использовать инструменты Vision AI, крайне важны правильное планирование, поддержка и настройка. Вот несколько ключевых проблем, о которых следует помнить:

  • Первоначальная стоимость и настройка: Начало работы с инструментами ИИ требует значительных инвестиций в оборудование, программное обеспечение и обучение, что может стать барьером для некоторых лабораторий.

  • Конфиденциальность и безопасность данных: работа с конфиденциальными данными, особенно в здравоохранении или клинических исследованиях, требует надежных мер безопасности для обеспечения соответствия нормам конфиденциальности.

  • Интеграция с существующими системами: Внедрение ИИ-решений может быть сложным, если новые инструменты нужно интегрировать с существующими системами управления лабораторией или рабочими процессами.

  • Постоянный Обслуживание и обновления: Модели ИИ требуют постоянного мониторинга, обновлений и тонкой настройки, чтобы оставаться эффективными, что может быть ресурсоемким.

Путь к созданию искусственного интеллекта в микробиологии

Компьютерное зрение в микробиологии движется в сторону инструментов, которые легче обучать и практичнее использовать в реальных лабораторных условиях. Исследователи фокусируются на моделях, которые требуют меньше данных для начала работы и могут быстрее адаптироваться при изменении лабораторных условий.

Одна из особенно увлекательных областей прогресса - мобильная микроскопия. Модели искусственного интеллекта теперь интегрируются в небольшие устройства, которые работают вне традиционных лабораторий. Эти системы захватывают изображения с микроскопа и анализируют их на месте, что делает их идеальными для использования в отдаленных районах с ограниченной инфраструктурой.

Рис. 6. Использование микроскопа на базе смартфона для визуализации клеток.

Основные выводы

По мере того как цифровая визуализация занимает центральное место в микробиологических исследованиях, потребность в более быстром и последовательном анализе продолжает расти. Компьютерное зрение помогает удовлетворить эту потребность, эффективно справляясь с такими основными задачами, как классификация клеток, подсчет колоний и сегментация со скоростью и точностью.

Многие лаборатории уже перешли от ручного анализа к системам, поддерживаемым искусственным интеллектом. Для лабораторий, работающих с большими объемами образцов или жесткими временными рамками, компьютерное зрение быстро становится практичным решением. Эти инструменты легко интегрируются в существующие рабочие процессы, что позволяет лабораториям внедрять их без существенных изменений.

Присоединяйся к нашему растущему сообществу! Изучи наш репозиторий на GitHub, чтобы глубже погрузиться в ИИ. Если ты заинтересован в использовании компьютерного зрения, ознакомься с нашими вариантами лицензирования. Узнай о компьютерном зрении в здравоохранении и ИИ в производстве на страницах наших решений! 

Логотип LinkedInЛоготип ТвиттераЛоготип FacebookСимвол копирования-ссылки

Читайте больше в этой категории

Давай вместе построим будущее
искусственного интеллекта!

Начни свое путешествие с будущим машинного обучения