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미생물학 분야에서 컴퓨터 비전의 응용 분야 탐색

Abirami Vina

5분 분량

2025년 4월 30일

미생물학에서 컴퓨터 비전이 어떻게 정확한 세포 분석, 효율적인 콜로니 계산 및 연구실에서의 개선된 진단을 지원할 수 있는지 알아보세요.

관찰은 미생물학의 핵심 부분으로, 연구원들은 현미경으로 세포를 분석하고, 박테리아 콜로니를 추적하고, 미생물 성장을 모니터링합니다. 이러한 유형의 관찰 작업은 연구 및 진단 프로세스 모두에 필수적입니다.

디지털 이미징 및 자동화 분야의 최근 혁신 덕분에 연구실에서는 이전보다 더 많은 시각적 데이터를 생산하고 있습니다. 예를 들어 고해상도 현미경은 단일 연구를 위해 수천 장의 이미지를 쉽게 캡처할 수 있습니다. 각 이미지에는 미세하고 중요한 세부 정보가 포함되어 있습니다. 

그러나 이를 개별적으로 검토하는 것은 느리고 일관성 없는 프로세스가 될 수 있습니다. 데이터 증가로 인해 더 빠르고 안정적인 이미지 분석이 필요하게 되었습니다. 

이 프로세스를 자동화하는 데 도움이 되는 핵심 기술 중 하나는 컴퓨터가 이미지나 비디오의 시각적 정보를 해석하고 분석할 수 있도록 하는 컴퓨터 비전입니다. 특히 Ultralytics YOLO11과 같은 Vision AI 모델은 세포 분류, 박테리아 콜로니 수 계산 및 미생물 성장 추적을 통해 미생물학 연구를 지원하는 데 사용되고 있습니다. 

본 문서에서는 미생물학 분야에서 컴퓨터 비전이 실험실 워크플로우를 어떻게 개선하고 과학자들이 보다 효율적이고 일관성 있게 작업할 수 있도록 지원하는지 살펴보겠습니다. 그럼 시작해 볼까요!

미생물학에서 컴퓨터 비전의 역할

YOLO11과 같은 모델로 구동되는 객체 감지 및 이미지 분류와 같은 컴퓨터 비전 작업은 패턴을 감지하고, 중요한 기능을 강조 표시하고, 그렇지 않으면 귀중한 시간과 노력을 소비할 반복적인 실험실 작업을 자동화하는 데 사용할 수 있습니다. 특정 응용 분야에 대해 자세히 알아보기 전에 컴퓨터 비전이 미생물학에서 어떻게 사용되고 있는지 자세히 살펴보겠습니다.

컴퓨터 비전을 사용한 세포 분류

세포 분류는 미생물학에서 가장 중요한 이미지 기반 작업 중 하나입니다. 연구실에서는 종종 염색된 이미지를 사용하여 세포 유형을 식별하고, 감염 징후를 감지하고, 현미경으로 특정 세포 특징을 강조 표시합니다. 수동 검토는 시간이 오래 걸리고 확장하기 어려울 수 있습니다. 현재 많은 연구실에서 컴퓨터 비전을 사용하여 세포를 자동으로 감지, 분할 및 분류하여 이 문제를 해결하고 있습니다.

예를 들어, 스코틀랜드의 University Hospital Monklands에서는 컴퓨터 비전을 사용하여 자궁 경부암 검진을 개선하는 파일럿 프로그램을 사용했습니다. 인유두종 바이러스(HPV) 양성 판정을 받은 환자의 샘플을 디지털화하여 Vision AI 모델을 사용하여 처리했습니다. 이 시스템은 세포 구조를 분석하고 의료 전문가의 검토를 위해 비정상적인 특징이 있는 세포를 표시했습니다.

이를 통해 팀은 워크플로 초기에 고위험 샘플의 우선순위를 지정할 수 있었습니다. 결과적으로 슬라이드 검토가 더 빠르고 집중적으로 이루어졌으며, 샘플 준비 또는 제출 방식을 변경하지 않고도 더 많은 스크리닝을 처리할 수 있었습니다.

Fig 1. 컴퓨터 비전을 사용한 세포 분류는 AI 지원 자궁경부암 검진을 향상시킬 수 있습니다.

콜로니 계수 자동화 및 성장 분석

콜로니 계수는 미생물 성장을 측정하고 샘플이 치료에 어떻게 반응하는지 평가하는 데 사용되는 실험실 기술입니다. 백신 개발, 임상 테스트 및 식품 안전에 널리 사용됩니다. 특히 콜로니가 겹치거나 플레이트 볼륨이 증가하면 수동으로 수행할 때 계수 프로세스가 복잡해질 수 있습니다.

이를 간소화하기 위해 인스턴스 분할과 같은 컴퓨터 비전 작업을 사용하여 콜로니 경계를 윤곽선으로 표시하고, 크기를 측정하고, 겹치는 경우에도 모양과 확산을 기준으로 각 콜로니를 계산할 수 있습니다. 이를 통해 검토 프로세스가 더 빨라지고 배치 간에 더 일관성이 유지됩니다.

예를 들어, 국제적으로 인정받는 백신 연구 시설에서는 컴퓨터 비전으로 구동되는 고급 콜로니 카운터인 ProtoCOL 3를 사용하고 있습니다. 이 시스템은 멀티웰 플레이트를 스캔하고 항체 노출 후 생존하는 콜로니를 분석합니다. 이러한 자동화를 통해 시설은 하루에 분석하는 플레이트 수를 16개에서 300개 이상으로 늘렸습니다.

Fig 2. 집락 계수 자동화의 한 예인 ProtoCOL 3를 살펴봅니다.

AI를 활용한 현미경 이미지 개선

미생물학자들은 미생물 세포의 구조와 행동을 관찰하기 위해 현미경을 정기적으로 사용합니다. 그러나 현미경 이미지는 세포 중첩, 희미한 경계 및 시각적 노이즈로 인해 분석하기 어려운 경우가 많습니다. 

이것이 바로 연구실에서 집락 계수 또는 세포 분류와 같은 작업을 위해 이미지를 처리하기 전에 이미지 분할 및 노이즈 감소와 같은 기술을 적용하여 이미지 선명도를 향상시키는 컴퓨터 비전 도구를 사용하는 이유입니다.

이 외에도, AI 기반 이미지 개선 기술은 미토콘드리아 및 뇌 조직과 같은 작은 세포 구조의 저해상도 이미지의 선명도를 향상시키는 데 사용되고 있습니다. 이를 통해 과학자들은 중요한 세부 사항을 실시간으로 분석하여 연구 속도를 높이고 진단 정확도를 향상시킬 수 있습니다.

Fig 3. 암세포 내 미토콘드리아 네트워크를 저해상도(왼쪽)로 보여주고 AI로 개선한 모습(오른쪽)입니다.

미생물학 분야에서 컴퓨터 비전의 실제 애플리케이션

이제 컴퓨터 비전이 미생물학에서 어떻게 사용되는지 논의했으므로 몇 가지 실제 응용 분야를 살펴보겠습니다.

컴퓨터 비전으로 가능해진 제약 연구

몸이 좋지 않을 때 복용하는 모든 약, 감기약처럼 간단한 약조차도 그 뒤에는 엄청난 노력이 숨어 있습니다. 제약 연구는 질병을 치료하기 위한 새로운 약물을 발견하고 개발하는 과정이며, 이 과정의 핵심은 화합물이 미생물 세포에 미치는 영향을 테스트하는 것입니다. 과학자들은 종종 배양 접시에서 박테리아를 배양하여 약물이 미생물 성장을 멈출 수 있는지 확인합니다.

현재 YOLO11과 같은 컴퓨터 비전 모델이 객체 탐지를 통해 배양 접시 분석을 가속화하는 데 사용되고 있습니다. YOLO11은 세포를 탐지하고 계수할 수 있으며, 이러한 정보는 치료에 대한 반응으로 세포의 성장 또는 수축을 추적하는 데 사용되어 연구 과정을 더 빠르고 효율적으로 만들 수 있습니다.

Fig 4. 세포를 감지하기 위해 YOLO11을 사용하는 예입니다.

비전 기반 임상 진단

제약 연구는 새로운 약물을 발견하고 테스트하는 데 중점을 두는 반면, 진단 연구소는 감염 또는 질병의 징후를 감지하기 위해 혈액과 같은 생물학적 샘플을 분석하는 데 중점을 둡니다. 진단 연구소의 목적은 상태를 진단하고, 질병 진행을 모니터링하고, 치료 결정을 안내하는 데 도움이 되는 정확하고 시기적절한 정보를 제공하는 것입니다.

이러한 분석에서 얻는 핵심적인 통찰력은 다를 수 있지만, 조사 자체는 매우 유사합니다. 이것이 바로 컴퓨터 비전이 이 분야에서도 영향력을 발휘하는 이유입니다. 예를 들어 혈액 분석에서 컴퓨터 비전은 적혈구, 백혈구, 혈소판과 같은 혈액 세포를 자동으로 분류하는 데 사용될 수 있습니다. 

이미지 분류 및 객체 감지를 적용하여 Vision AI 모델은 이러한 세포를 정확하게 감지하고 분류하여 검토 프로세스를 간소화하고 연구원이나 임상의가 즉각적인 주의가 필요한 영역에 집중할 수 있도록 돕습니다.

Fig 5. 혈액 세포를 감지하기 위해 컴퓨터 비전을 사용하는 예시입니다.

미생물학에서 컴퓨터 비전의 장단점

컴퓨터 비전을 통해 미생물학 연구소는 이미지 기반 작업을 간소화하여 효율성과 일관성을 향상시킬 수 있습니다. 분석 속도를 높이고, 수동 작업을 줄이고, 프로세스 전반에 걸쳐 반복성을 향상시킵니다. 다음은 미생물학에서 컴퓨터 비전을 사용하는 주요 이점 중 일부입니다.

  • 비용 효율성: 이미지 분석을 자동화하면 추가 인력의 필요성이 줄어들어 인건비를 낮추면서 생산성을 높일 수 있습니다.

  • 수동 오류 감소: 모델이 모든 이미지에 동일한 규칙을 적용하므로 시각적 오류와 일관성 없는 관찰이 줄어듭니다.

  • 원격 및 실시간 사용 지원: 이미지를 다른 위치에서 처리하고 검토할 수 있습니다. 이를 통해 연구원은 실시간으로 데이터를 공동으로 작업하거나 모니터링할 수 있습니다.

  • 확장성: 데이터 볼륨이 증가함에 따라 컴퓨터 비전 시스템은 노동력이나 리소스의 비례적인 증가 없이도 더 큰 데이터 세트를 쉽게 처리하도록 확장할 수 있습니다.

이러한 장점에도 불구하고 고려해야 할 몇 가지 제한 사항도 있습니다. 비전 AI 도구를 최대한 활용하려면 적절한 계획, 지원 및 설정이 중요합니다. 염두에 두어야 할 몇 가지 주요 과제는 다음과 같습니다.

  • 초기 비용 및 설정: AI 도구를 시작하려면 하드웨어, 소프트웨어 및 교육에 상당한 투자가 필요하며, 이는 일부 연구실에는 장벽이 될 수 있습니다.

  • 데이터 개인 정보 보호 및 보안: 특히 의료 또는 임상 연구에서 민감한 데이터를 처리하려면 개인 정보 보호 규정 준수를 보장하기 위한 강력한 보안 조치가 필요합니다.

  • 기존 시스템과의 통합: 새로운 도구를 기존 실험실 관리 시스템 또는 워크플로우와 통합해야 하는 경우 AI 솔루션 구현이 어려울 수 있습니다.

  • 지속적인 유지 관리 및 업데이트: AI 모델은 효과성을 유지하기 위해 지속적인 모니터링, 업데이트 및 미세 조정이 필요하며, 이는 리소스 집약적일 수 있습니다.

미생물학 분야에서 Vision AI의 미래

미생물학 분야의 컴퓨터 비전은 훈련이 더 쉽고 실제 실험실 환경에서 사용하기 더 실용적인 도구로 발전하고 있습니다. 연구자들은 시작하는 데 필요한 데이터가 적고 실험실 조건이 변할 때 더 빠르게 적응할 수 있는 모델에 집중하고 있습니다.

특히 흥미로운 발전 분야 중 하나는 모바일 현미경 검사입니다. AI 모델은 이제 기존 실험실 설정 외부에서 작동하는 소형 장치에 통합되고 있습니다. 이러한 시스템은 현미경 이미지를 캡처하고 현장에서 분석하므로 인프라가 제한된 원격 지역에서 사용하기에 이상적입니다.

그림 6. 세포 이미징을 위한 스마트폰 기반 현미경 사용(출처: journals.plos.org).

주요 내용

디지털 이미징이 미생물 연구의 중심이 됨에 따라 더 빠르고 일관된 분석에 대한 요구가 계속 증가하고 있습니다. 컴퓨터 비전은 세포 분류, 콜로니 계산 및 분할과 같은 핵심 작업을 빠르고 정확하게 처리하여 이러한 요구를 충족하는 데 도움이 됩니다.

많은 연구실에서 이미 수동 검토에서 AI 지원 시스템으로 전환했습니다. 높은 샘플 볼륨 또는 촉박한 일정으로 작업하는 연구실의 경우 컴퓨터 비전이 빠르게 실용적인 솔루션이 되고 있습니다. 이러한 도구는 기존 워크플로에 쉽게 통합할 수 있으므로 연구실에서 큰 변경 없이도 도입할 수 있습니다.

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