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Explorando las aplicaciones de la visión artificial en microbiología

Descubra cómo la visión artificial en microbiología puede respaldar el análisis preciso de células, el conteo eficiente de colonias y el diagnóstico mejorado en laboratorios de investigación.

La observación es una parte fundamental de la microbiología, en la que los investigadores analizan células al microscopio, track colonias bacterianas y controlan el crecimiento microbiano. Este tipo de tareas de observación son esenciales tanto para la investigación como para los procesos de diagnóstico.

Gracias a las recientes innovaciones en imagenología digital y automatización, los laboratorios ahora producen más datos visuales que nunca. Por ejemplo, un microscopio de alta resolución puede capturar fácilmente miles de imágenes para un solo estudio. Cada imagen contiene detalles minuciosos e importantes. 

Sin embargo, revisarlos individualmente puede ser un proceso lento e inconsistente. Este aumento en los datos ha creado la necesidad de un análisis de imágenes más rápido y fiable. 

Una de las tecnologías clave que ayudan a automatizar este proceso es la visión por ordenador, que permite a los ordenadores interpretar y analizar la información visual de imágenes o vídeos. En particular, los modelos de IA de visión como Ultralytics YOLO11 se están utilizando para apoyar la investigación microbiológica mediante la clasificación de células, el recuento de colonias bacterianas y el seguimiento del crecimiento microbiano. 

En este artículo, exploraremos cómo la visión artificial en microbiología está mejorando los flujos de trabajo de laboratorio y permitiendo a los científicos trabajar de manera más eficiente y consistente. ¡Empecemos!

El papel de la visión artificial en microbiología

Tareas de visión por ordenador como la detección de objetos y la clasificación de imágenes, impulsadas por modelos como YOLO11, pueden utilizarse para detect patrones, resaltar características importantes y automatizar tareas de laboratorio repetitivas que, de otro modo, consumirían un tiempo y un esfuerzo valiosos. Antes de entrar en aplicaciones concretas, veamos cómo se utiliza la visión por ordenador en microbiología.

Clasificación celular utilizando visión artificial

La clasificación celular es una de las tareas basadas en imágenes más críticas en microbiología. Los laboratorios suelen utilizar imágenes teñidas para ayudar a identificar tipos de células, detect signos de infección y resaltar características celulares específicas en el microscopio. Las revisiones manuales llevan tiempo y pueden ser difíciles de escalar. Muchos laboratorios utilizan ahora la visión por ordenador para detect, segment y classify automáticamente las células.

Por ejemplo, en el Hospital Universitario Monklands de Escocia, un programa piloto utilizó la visión artificial para mejorar el cribado del cáncer de cuello uterino. Las muestras de pacientes que dieron positivo en la prueba del virus del papiloma humano (VPH) se digitalizaron y se procesaron utilizando modelos de Vision AI. El sistema analizó las estructuras celulares y marcó cualquier célula con características inusuales para que la revisara un experto médico.

Esto ayudó al equipo a priorizar las muestras de alto riesgo al principio del flujo de trabajo. Como resultado, las revisiones de diapositivas se hicieron más rápidas y enfocadas, y pudieron manejar más exámenes sin cambiar la forma en que se preparaban o enviaban las muestras.

Fig. 1. La clasificación de células mediante visión artificial puede mejorar el cribado cervical asistido por IA.

Automatización del conteo de colonias y análisis de crecimiento

El conteo de colonias es una técnica de laboratorio utilizada para medir el crecimiento microbiano y evaluar cómo responden las muestras al tratamiento. Se utiliza ampliamente en el desarrollo de vacunas, las pruebas clínicas y la seguridad alimentaria. El proceso de conteo puede ser complejo cuando se realiza manualmente, especialmente cuando las colonias se superponen o aumentan los volúmenes de las placas.

Para agilizar esto, tareas de visión artificial como la segmentación de instancias pueden utilizarse para delinear los límites de las colonias, medir su tamaño y contar cada colonia en función de su forma y extensión, incluso en casos de superposición. Esto hace que el proceso de revisión sea más rápido y consistente entre lotes.

Por ejemplo, un centro de investigación de vacunas reconocido internacionalmente está utilizando ProtoCOL 3, un contador de colonias avanzado impulsado por visión artificial. El sistema escanea placas multi-pocillos y analiza las colonias que sobreviven después de la exposición a anticuerpos. Con esta automatización, la instalación aumentó su producción del análisis de 16 placas a más de 300 por día.

Fig 2. Una mirada a ProtoCOL 3: un ejemplo de automatización del conteo de colonias.

Mejora de imágenes de microscopía con IA

Los microbiólogos utilizan regularmente microscopios para observar la estructura y el comportamiento de las células microbianas. Sin embargo, las imágenes de microscopio a menudo son difíciles de analizar debido a la superposición de células, los límites débiles y el ruido visual. 

Esta es exactamente la razón por la que los laboratorios están recurriendo a herramientas de visión artificial que mejoran la claridad de la imagen aplicando técnicas como la segmentación de imágenes y la reducción de ruido antes de procesarlas para tareas como el conteo de colonias o la clasificación celular.

Más allá de esto, la mejora de imágenes impulsada por IA se está utilizando para mejorar la claridad de imágenes de baja resolución de pequeñas estructuras celulares, como las mitocondrias y el tejido cerebral. Esto permite a los científicos analizar detalles importantes en tiempo real, acelerando la investigación y mejorando la precisión del diagnóstico.

Fig. 3. Una red mitocondrial en una célula cancerosa, mostrada en baja resolución (izquierda) y mejorada por IA (derecha).

Aplicaciones en el mundo real de la visión artificial en microbiología

Ahora que hemos discutido cómo se utiliza la visión artificial en microbiología, vamos a profundizar en algunas aplicaciones del mundo real.

Investigación farmacéutica habilitada por la visión artificial

Cualquier medicamento que tomamos cuando no nos sentimos bien, incluso algo tan simple como un remedio para el resfriado, tiene un gran esfuerzo detrás. La investigación farmacéutica es el proceso de descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos para tratar enfermedades, y una parte clave de esto implica probar cómo los compuestos afectan a las células microbianas. Los científicos a menudo cultivan bacterias en placas de cultivo para ver si un fármaco puede detener el crecimiento microbiano.

Ahora vemos cómo se utilizan modelos de visión por ordenador como YOLO11 para acelerar el análisis de placas de cultivo mediante la detección de objetos. YOLO11 puede detect y contar células, y esta información puede utilizarse a su vez para track su crecimiento o contracción en respuesta a los tratamientos, lo que agiliza y hace más eficiente el proceso de investigación.

Fig. 4. Ejemplo de uso de YOLO11 para detect células.

Diagnóstico clínico impulsado por la visión

Mientras que la investigación farmacéutica se ocupa de descubrir y probar nuevos medicamentos, los laboratorios de diagnóstico se centran en analizar muestras biológicas, como la sangre, para detect signos de infección o enfermedad. El objetivo de los laboratorios de diagnóstico es proporcionar información precisa y oportuna que ayude a diagnosticar afecciones, seguir la evolución de la enfermedad y orientar las decisiones terapéuticas.

Aunque los conocimientos básicos de estos análisis pueden diferir, las investigaciones en sí son bastante similares, razón por la cual la visión por ordenador también tiene impacto en este campo. Por ejemplo, en el análisis de sangre, la visión por ordenador puede utilizarse para classify automáticamente células sanguíneas como glóbulos rojos, glóbulos blancos y plaquetas. 

Aplicando la clasificación de imágenes y la detección de objetos, los modelos de Vision AI pueden detect y categorizar con precisión estas células, agilizando el proceso de revisión y ayudando a los investigadores o médicos a centrarse en las áreas que necesitan atención inmediata.

Fig. 5. Utilización de la visión por ordenador para detect células sanguíneas.

Pros y contras de la visión artificial en microbiología

La visión artificial permite a los laboratorios de microbiología agilizar las tareas basadas en imágenes, mejorando la eficiencia y la consistencia. Acelera el análisis, reduce el trabajo manual y mejora la repetibilidad en todos los procesos. Estos son algunos otros beneficios clave del uso de la visión artificial en microbiología:

  • Eficiencia de costes: La automatización del análisis de imágenes reduce la necesidad de personal adicional, lo que disminuye los costes laborales y aumenta la productividad.

  • Menos errores manuales: Se reducen los errores visuales y las observaciones inconsistentes, ya que los modelos aplican las mismas reglas en cada imagen.

  • Soporta el uso remoto y en tiempo real: Las imágenes pueden procesarse y revisarse desde diferentes ubicaciones. Esto ayuda a los investigadores a colaborar o supervisar los datos en tiempo real.

  • Escalabilidad: A medida que aumentan los volúmenes de datos, los sistemas de visión artificial pueden escalar fácilmente para manejar conjuntos de datos más grandes sin requerir aumentos proporcionales en mano de obra o recursos.

A pesar de estas ventajas, también hay algunas limitaciones que se deben considerar. Para aprovechar al máximo las herramientas de Vision AI, es vital una planificación, soporte y configuración adecuados. Estos son algunos de los desafíos clave que debe tener en cuenta:

  • Costo inicial y configuración: Comenzar con las herramientas de IA requiere una inversión significativa en hardware, software y formación, lo que puede ser una barrera para algunos laboratorios.

  • Privacidad y seguridad de los datos: El manejo de datos sensibles, especialmente en la atención sanitaria o la investigación clínica, requiere medidas de seguridad robustas para garantizar el cumplimiento de las normas de privacidad.

  • Integración con los sistemas existentes: La implementación de soluciones de IA puede ser un reto si las nuevas herramientas necesitan integrarse con los sistemas o flujos de trabajo de gestión de laboratorio existentes.

  • Mantenimiento y actualizaciones continuos: Los modelos de IA requieren una supervisión, actualizaciones y ajustes continuos para seguir siendo eficaces, lo que puede requerir muchos recursos.

El futuro de la IA visual en microbiología

La visión artificial en microbiología avanza hacia herramientas que son más fáciles de entrenar y más prácticas para usar en entornos de laboratorio reales. Los investigadores se están centrando en modelos que necesitan menos datos para empezar y pueden adaptarse más rápidamente cuando cambian las condiciones del laboratorio.

Un área de progreso particularmente fascinante es la microscopía móvil. Los modelos de IA se están integrando ahora en pequeños dispositivos que funcionan fuera de las configuraciones de laboratorio tradicionales. Estos sistemas capturan imágenes de microscopio y las analizan in situ, lo que los hace ideales para su uso en áreas remotas con infraestructura limitada.

Fig. 6. Uso de un microscopio basado en smartphone para obtener imágenes de células (Fuente: journals.plos.org).

Conclusiones clave

A medida que las imágenes digitales se vuelven fundamentales para la investigación microbiológica, la demanda de análisis más rápidos y consistentes continúa creciendo. La visión artificial ayuda a satisfacer esta necesidad al manejar de manera eficiente tareas centrales como la clasificación de células, el conteo de colonias y la segmentación con velocidad y precisión.

Muchos laboratorios ya han pasado de las revisiones manuales a los sistemas con soporte de IA. Para los laboratorios que manejan grandes volúmenes de muestras o plazos ajustados, la visión artificial se está convirtiendo rápidamente en una solución práctica. Estas herramientas son fáciles de integrar en los flujos de trabajo existentes, lo que permite a los laboratorios adoptarlas sin grandes cambios.

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