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Theia Scientific redefine el análisis de datos de microscopía con los modelos Ultralytics YOLO

Problema

Theia Scientific se propuso encontrar un modelo de Visión IA que mejorara la velocidad, la precisión y la reproducibilidad del análisis de imágenes de microscopía.

Solución

Al integrar los modelosYOLO Ultralytics en su plataforma, Theia Scientific transformó la forma en que se procesan los datos de microscopía, haciendo que el análisis sea más eficiente y fiable.

La investigación científica en campos como la ciencia de los materiales y la nanotecnología a menudo depende de la microscopía óptica, de sonda de barrido y de partículas cargadas para explorar estructuras invisibles al ojo humano. Por ejemplo, la microscopía electrónica de transmisión (TEM) es una herramienta clave, capaz de capturar detalles finos a escala nanométrica y atómica.

Lamentablemente, una vez adquiridas estas imágenes, su análisis puede resultar lento y complejo, y a menudo requiere un esfuerzo manual considerable y conocimientos especializados. Para mejorar este proceso, Theia Scientific desarrolló la plataforma Theiascope™, un sistema de análisis de imágenes de microscopía en tiempo real que integra los modelosUltralytics YOLO para automatizar la detección de imágenes, la segmentación y las mediciones cuantitativas, haciendo que la microscopía sea más rápida, eficiente y reproducible.

Explorando el papel de la IA de visión en la imagen científica

Fundada por los hermanos Kevin y Christopher Field, Theia Scientific desarrolla herramientas de software avanzadas para acelerar la investigación en microscopía. Con experiencia en ciencia de los materiales, automatización industrial, electrónica e ingeniería de software, se centran en reducir los cuellos de botella a los que se enfrentan científicos, ingenieros e investigadores al analizar datos de imágenes complejos. 

Su producto estrella, la plataforma Theiascope™, integra la visión por ordenador para detect, segment y medir automáticamente características en imágenes de microscopía electrónica. Al basarse en Vision AI en lugar de en la anotación y el trazado manuales, la plataforma proporciona resultados coherentes y reproducibles.

¿Por qué las imágenes de microscopía son difíciles de analizar manualmente?

Las imágenes de microscopía, especialmente las capturadas con TEM, son muy detalladas pero difíciles de interpretar. Cada imagen contiene cientos o miles de características y estructuras finas, como granos y límites, que deben identificarse, anotarse, trazarse y/o medirse cuidadosamente para extraer datos significativos. Tradicionalmente, esto se ha hecho a mano, lo cual es lento y puede variar de persona a persona. Dos investigadores podrían anotar la misma imagen de manera diferente, lo que lleva a resultados inconsistentes y grandes barras de error.

Este proceso se vuelve aún más complejo cuando se involucran grandes conjuntos de datos. Para obtener información confiable, a menudo es necesario analizar miles de imágenes, lo que puede llevar semanas o incluso meses utilizando métodos manuales. Además de eso, las variaciones en el contraste, el ruido y las estructuras superpuestas hacen que el proceso sea aún más difícil.

Para los investigadores que pretenden estudiar la evolución microestructural o track cambios a lo largo del tiempo, estos problemas pueden ralentizar la investigación. Theia Scientific reconoció que estos problemas requerían una solución más automatizada y fiable.

Mejora de los flujos de trabajo de microscopía mediante los modelosYOLO Ultralytics

Tras explorar diferentes enfoques para automatizar el análisis de datos de microscopía, Theia Scientific vio que los modelosYOLO Ultralytics tralytics ofrecían la velocidad, precisión y flexibilidad necesarias para el análisis de imágenes de microscopía en tiempo real, permitiendo obtener resultados cuantitativos instantáneos en el microscopio mientras los experimentos aún están en curso. Modelos Ultralytics YOLO como Ultralytics YOLO11 y Ultralytics YOLOv8 admiten tareas de visión por ordenador como la detección de objetos (identificar y localizar características individuales en una imagen) y la segmentación de instancias (delinear cada característica a nivel de píxel). Estas tareas permiten detect estructuras a nanoescala, como granos y límites, directamente en las imágenes TEM a medida que se capturan.

Fig. 1. Flujo de trabajo actual de análisis de datos e imágenes de microscopía. Los científicos, ingenieros e investigadores buscan, en última instancia, descubrimientos y respuestas al final del flujo de trabajo. Mientras tanto, el flujo de trabajo es inconexo y laborioso, y el tiempo/trabajo relativo necesario para cada paso se muestra en la parte inferior. La detección y agregación de características son las etapas que más tiempo consumen en el flujo de trabajo. Las flechas grises que conducen de vuelta a la adquisición representan la necesidad de volver a adquirir datos porque los datos actuales no son útiles. Fuente: Theia Scientific.

Por ejemplo, en un estudio reciente sobre películas finas policristalinas, se utilizaron los modelos Theiascope™ y Ultralytics YOLO para identificar y medir las estructuras de grano que influyen en las propiedades de los materiales utilizados en electrónica, revestimientos y dispositivos energéticos. Las distribuciones precisas del tamaño de grano son fundamentales para comprender cómo evolucionan estas películas durante los experimentos. 

Una de las principales razones por las que los modelosYOLO Ultralytics son tan eficaces en estos casos es su capacidad para interpolar grandes conjuntos de datos. En lugar de tener que etiquetar todos los fotogramas de un experimento, los investigadores pueden anotar solo una pequeña fracción de las imágenes, entrenar un modelo YOLO y dejar que analice de forma fiable miles de fotogramas adicionales. Esto permite track crecimiento de los granos y los cambios en los límites de los experimentos de TEM con lapso de tiempo con una mínima intervención manual.

¿Por qué elegir los modelosYOLO Ultralytics ?

En el estudio sobre películas finas policristalinas comentado anteriormente, Ultralytics YOLOv8 resultó ser hasta 43 veces más rápido que U-Net (un modelo utilizado a menudo para el análisis científico de imágenes). Esta velocidad hace que YOLO resulte práctico para el análisis en microscopio en tiempo real. 

Mientras que U-Net es preciso pero lento, YOLO combina velocidad y precisión, con una exactitud de las mediciones granulométricas del 3% respecto a la realidad sobre el terreno. Su diseño también lo hace más flexible, ya que permite manejar diferentes escalas y configuraciones de formación con facilidad. Para los investigadores, esto significa resultados más rápidos sin sacrificar la fiabilidad, lo que resulta ideal para acelerar los flujos de trabajo de microscopía.

Fig. 2. En comparación con el trazado manual (b) y U-Net (c), la segmentación YOLOv8 (d) proporciona contornos más nítidos y precisos en imágenes de microscopía.(Fuente.)

Reducción de los sesgos y aumento de la coherencia en microscopía con YOLO

A través de la plataforma Theiascope™, Theia Scientific mostró que los modelos Ultralytics YOLO pueden acelerar el análisis de imágenes de microscopía y los experimentos de TEM, al tiempo que apoyan la investigación reproducible a largo plazo. La plataforma está diseñada para ser agnóstica con respecto a los microscopios, lo que significa que los modelos YOLO se utilizan para analizar imágenes recogidas de diferentes instrumentos sin necesidad de personalizar los procesos. Esta flexibilidad garantiza la coherencia de los flujos de trabajo en distintos experimentos, operadores y entornos.

La reproducibilidad es otro resultado clave. La investigación científica a menudo requiere que los resultados se revisen y validen años después. Con varios modelos YOLO integrados en el Theiascope™, los investigadores pueden volver a ejecutar modelos antiguos como Ultralytics YOLOv5 en conjuntos de datos archivados y obtener resultados coherentes, para luego compararlos directamente con los resultados de modelos más recientes como Ultralytics YOLO11. Esto facilita la verificación de los resultados, incluso a medida que evolucionan los métodos de IA.

Fig. 3. Plataforma Theiascope™. Las imágenes de microscopía electrónica se capturan y transmiten desde el ordenador de adquisición a un dispositivo GPU que ejecuta una aplicación web, una base de datos de series temporales y los modelos Ultralytics YOLO . Las actualizaciones y los nuevos modelos Ultralytics YOLO pueden enviarse a la plataforma mediante actualizaciones OTA. Fuente: Theia Scientific.

Además, los modelosYOLO Ultralytics proporcionan a la plataforma la escalabilidad necesaria para manejar grandes conjuntos de datos. Sus capacidades de inferencia en tiempo real permiten analizar miles de imágenes TEM en el tiempo que llevaría analizar manualmente sólo unas pocas. Esto permite a los investigadores seguir procesos dinámicos como el crecimiento del grano a lo largo de experimentos completos, generando nuevos conocimientos y desbloqueando experimentos novedosos a la escala y velocidad necesarias para la investigación de vanguardia.

Integración de la Visión Artificial avanzada en las herramientas de investigación de última generación

Theia Scientific considera los modelos Ultralytics YOLO como la base del futuro de la microscopía. Al seguir perfeccionando los métodos de formación y los enfoques de calibración, pretenden mejorar aún más la precisión en todas las escalas y condiciones experimentales. 

De cara al futuro, Theia Scientific planea expandir Theiascope™ para dar soporte a experimentos in situ más complejos y conjuntos de datos multimodales. Creen que es probable que la IA de visión se convierta en una parte estándar de los flujos de trabajo de investigación de próxima generación, lo que permitirá un descubrimiento más rápido y conocimientos más profundos en todos los dominios científicos.

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Preguntas frecuentes

¿Qué son los modelosYOLO Ultralytics ?

Los modelosYOLO de Ultralytics son arquitecturas de visión por ordenador desarrolladas para analizar datos visuales a partir de imágenes y entradas de vídeo. Estos modelos pueden entrenarse para tareas como la detección de objetos, la clasificación, la estimación de poses, el seguimiento y la segmentación de instanciasUltralytics

  • Ultralytics YOLOv5
  • Ultralytics YOLOv8
  • Ultralytics YOLO11

¿Cuál es la diferencia entre los modelosYOLO Ultralytics ?

Ultralytics YOLO11 es la última versión de nuestros modelos de Visión por Computador. Al igual que sus versiones anteriores, soporta todas las tareas de visión por computador que la comunidad de Vision AI ha llegado a amar de YOLOv8. El nuevo YOLO11, sin embargo, viene con un mayor rendimiento y precisión, lo que lo convierte en una poderosa herramienta y en el aliado perfecto para los desafíos de la industria en el mundo real.

¿Qué modeloYOLO Ultralytics debo elegir para mi proyecto?

El modelo que elija usar depende de los requisitos específicos de su proyecto. Es clave tener en cuenta factores como el rendimiento, la precisión y las necesidades de implementación. Aquí hay una descripción general rápida:

  • Algunas de las principales características de Ultralytics YOLOv8:
  1. Madurez y estabilidad: YOLOv8 es un marco probado y estable con amplia documentación y compatibilidad con versiones anteriores de YOLO , lo que lo hace ideal para integrarlo en los flujos de trabajo existentes.
  2. Facilidad de uso: YOLOv8 es perfecto para equipos de todos los niveles gracias a su sencilla instalación.
  3. Rentabilidad: Requiere menos recursos computacionales, lo que lo convierte en una excelente opción para proyectos con presupuesto limitado.
  • Algunas de las principales características de Ultralytics YOLO11:
  1. Mayor precisión: YOLO11 supera a YOLOv8 en las pruebas comparativas, logrando una mayor precisión con menos parámetros.
  2. Características avanzadas: Admite tareas de vanguardia como la estimación de la pose, el seguimiento de objetos y los cuadros delimitadores orientados (OBB), ofreciendo una versatilidad inigualable.
  3. Eficiencia en tiempo real: Optimizado para aplicaciones en tiempo real, YOLO11 ofrece tiempos de inferencia más rápidos y destaca en dispositivos periféricos y tareas sensibles a la latencia.
  4. Adaptabilidad: Gracias a su amplia compatibilidad de hardware, YOLO11 es idóneo para su implantación en dispositivos periféricos, plataformas en la nube y GPU NVIDIA .

¿Qué licencia necesito?

Los repositoriosYOLO Ultralytics , como YOLOv5 y YOLO11, se distribuyen bajo la licencia AGPL-3.0 0 por defecto. Esta licencia, aprobada por la OSI, está diseñada para estudiantes, investigadores y entusiastas, promueve la colaboración abierta y exige que cualquier software que utilice componentes AGPL-3.0 0 también sea de código abierto. Aunque esto garantiza la transparencia y fomenta la innovación, puede que no se ajuste a los casos de uso comercial.
Si su proyecto implica la integración del software de Ultralytics y los modelos de IA en productos o servicios comerciales y desea evitar los requisitos de código abierto de AGPL-3 AGPL-3.0, lo ideal es una licencia de empresa.

Los beneficios de la Licencia Enterprise incluyen:

  • Flexibilidad comercial: Modifique e incruste el código fuente y los modelos Ultralytics YOLO en productos de su propiedad sin necesidad de adherirse al requisito AGPL-3.0 de código abierto de su proyecto.
  • Desarrollo propietario: Obtenga plena libertad para desarrollar y distribuir aplicaciones comerciales que incluyan el código y los modelos Ultralytics YOLO .

Para garantizar una integración perfecta y evitar las limitaciones AGPL-3.0 , solicite una licencia de empresa de Ultralytics mediante el formulario proporcionado. Nuestro equipo le ayudará a adaptar la licencia a sus necesidades específicas.

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