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Ultralytics YOLO11 et la vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes

Abirami Vina

5 min de lecture

25 mars 2025

Découvrez comment Ultralytics YOLO11 et la vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes peuvent être utilisés pour automatiser des tâches telles que le comptage des feuilles, la détection de la sécheresse et la prédiction des maladies.

L'agriculture est essentielle à notre approvisionnement alimentaire, et les chercheurs sont constamment à la recherche de moyens d'optimiser les processus liés à un défi clé : le changement climatique. Avec le réchauffement climatique qui perturbe les saisons de croissance et la population mondiale qui augmente, la nécessité de développer des cultures capables de résister à des environnements en constante évolution est bien réelle. Le phénotypage des plantes est un élément clé de cette recherche.

Le phénotypage des plantes consiste à étudier les propriétés des plantes telles que la taille, la couleur, la croissance et les structures racinaires. En comprenant comment les plantes réagissent à différentes conditions, nous pouvons identifier celles qui sont les mieux équipées pour faire face à la sécheresse, à la chaleur ou à un sol pauvre. Ces données peuvent être utilisées pour prendre des décisions concernant les cultures à reproduire afin d'accroître la productivité agricole.

En général, le phénotypage des plantes implique des observations visuelles manuelles, ce qui peut être long et laborieux. La vision par ordinateur, une branche de l'intelligence artificielle (IA), peut réinventer la façon dont nous étudions les plantes. Grâce à la vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes, nous pouvons détecter et analyser automatiquement les plantes à partir d'images ou de vidéos, ce qui améliore considérablement la vitesse, la cohérence et la précision.

Par exemple, les modèles de vision artificielle comme Ultralytics YOLO11 peuvent traiter de vastes volumes de données visuelles de plantes capturées par des drones, des robots terrestres ou des appareils portables. Grâce à sa prise en charge de diverses tâches de vision artificielle, YOLO11 peut être utilisé pour analyser diverses propriétés des plantes dans des images et des vidéos.

Dans cet article, nous allons examiner de plus près les défis de la phénotypage traditionnel des plantes et explorer comment les modèles de vision par ordinateur comme YOLO11 favorisent des pratiques agricoles plus intelligentes et plus durables.

Qu'est-ce que le phénotypage des plantes ?

Le phénotypage des plantes est le processus d'observation et d'analyse des caractéristiques physiques et biochimiques d'une plante. En recueillant des données telles que la hauteur de la plante, la surface foliaire, le taux de croissance et les réponses au stress, nous pouvons obtenir des informations précieuses sur la façon dont les plantes poussent et réagissent à divers environnements. 

Les données collectées par le biais du phénotypage des plantes sont essentielles pour l'amélioration des cultures, la prédiction des rendements et l'amélioration de la résilience climatique. Ces points de données aident également les agriculteurs et les experts agricoles à sélectionner les variétés de plantes les plus performantes pour la culture ou la sélection ultérieures.

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Fig. 1. Un chercheur mesurant la hauteur de la plante à l'aide d'une règle.

Aujourd'hui encore, le phénotypage des plantes implique généralement des méthodes manuelles. Les chercheurs ou les agriculteurs experts se rendent dans les champs, mesurent physiquement les plantes et enregistrent les données à la main. Malgré leur valeur, ces méthodes nécessitent beaucoup d'efforts humains. Elles peuvent également entraîner des incohérences, car différentes personnes peuvent observer et interpréter les caractéristiques des plantes différemment. 

Le phénotypage moderne ou le phénotypage à haut débit des plantes, cependant, se concentre sur la cohérence, la précision et la collecte de données non destructive. Les plantes sont surveillées à l'aide d'outils avancés tels que des caméras RVB (caméras couleur standard), des capteurs hyperspectraux (dispositifs qui capturent une large gamme d'informations de couleur, même au-delà de ce que l'œil peut voir) et des systèmes LiDAR (Light Detection and Ranging) (scanners laser qui créent des cartes 3D détaillées) pour capturer des données à haute résolution sans perturber physiquement les plantes.

Combinées à l'IA et à la vision par ordinateur, ces méthodes non invasives peuvent contribuer à améliorer considérablement la précision et la cohérence du phénotypage des plantes.

Limites du phénotypage traditionnel des plantes

Bien que fondamentales, les méthodes traditionnelles de phénotypage des plantes présentent plusieurs limites et défis. Voici quelques-uns de leurs principaux inconvénients :

  • Méthodes manuelles : Les méthodes traditionnelles reposaient sur l'effort humain, et des outils physiques comme les règles et les pieds à coulisse étaient utilisés. Elles étaient chronophages et subjectives, surtout dans les grands champs agricoles.
  • Échantillonnage destructif : Les plantes étaient souvent endommagées ou déracinées pour étudier leurs propriétés internes. L'échantillonnage destructif rend impossible le suivi de la réaction des plantes à différents intervalles de temps.
  • Difficulté à capturer les changements dynamiques : Les méthodes traditionnelles capturent souvent un instantané dans le temps, manquant ainsi l'évolution des caractéristiques des plantes au fil du temps.

Le phénotypage à haut débit des plantes se concentre sur l'automatisation du phénotypage des plantes afin de rendre les mesures plus précises et de maintenir la cohérence. Il ouvre de nouvelles portes à l'innovation agricole et à l'agriculture intelligente.

Le rôle de la vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes

La vision par ordinateur est une technologie qui permet aux machines de voir et d'interpréter les informations visuelles du monde réel, de la même manière que les humains. Elle comprend trois étapes clés : l'acquisition, le traitement et l'analyse des images. 

Tout d'abord, l'acquisition d'images implique la capture de données visuelles à l'aide de divers capteurs, tels que des caméras et des drones. Ensuite, le traitement d'image améliore la qualité et la clarté des images à l'aide de techniques telles que la réduction du bruit et la correction des couleurs. Enfin, l'analyse d'image extrait des informations significatives des images traitées à l'aide de différentes tâches de vision par ordinateur telles que la détection d'objets et la segmentation d'instances. Des modèles comme YOLO11 peuvent être utilisés pour cette analyse d'image et prendre en charge de telles tâches. 

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Fig. 2. YOLO11 peut être utilisé pour détecter les légumes dans un champ.

Autres technologies impliquées dans le phénotypage à haut débit des plantes

Au-delà de la vision par ordinateur, le phénotypage à haut débit des plantes repose sur plusieurs technologies innovantes pour capturer des images et des vidéos détaillées des plantes. Voici quelques-uns de ces outils clés et comment ils améliorent la collecte de données :

  • Imagerie RVB : Les caméras RVB standard sont couramment utilisées pour capturer des images de plantes. L'imagerie RVB est essentielle à l'analyse phénotypique et sert souvent d'étape initiale dans les évaluations plus complexes.
  • Imagerie hyperspectrale : Cette technologie capture une large gamme de bandes spectrales au-delà du spectre visible. Elle fournit des informations détaillées sur la composition chimique d'une plante et aide à détecter des facteurs tels que les niveaux de chlorophylle, la teneur en eau et les carences nutritionnelles.
  • Imagerie thermique : Les caméras thermiques mesurent le rayonnement infrarouge émis par les plantes, offrant ainsi un aperçu de la température de surface. Cette méthode non invasive est utile pour surveiller la santé des plantes et identifier rapidement les problèmes potentiels.
  • Imagerie 3D: Les caméras de profondeur et la technologie LiDAR créent des modèles tridimensionnels de plantes. L'imagerie 3D est essentielle pour analyser les structures complexes des plantes et comprendre comment les variations influencent la croissance et la productivité.
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Fig 3. Principales technologies utilisées dans le phénotypage des plantes à haut débit. Image de l'auteur.

Applications d'Ultralytics YOLO11 dans le phénotypage des plantes

Les modèles de vision par ordinateur sont progressivement utilisés dans le phénotypage des plantes pour un large éventail de tâches. Du comptage des feuilles à l'analyse morphologique détaillée, ces technologies transforment notre façon de comprendre et de gérer la santé des plantes. Examinons quelques applications concrètes dans lesquelles des modèles comme YOLO11 peuvent aider au phénotypage des plantes.

Comptage de feuilles et estimation de la sécheresse à l'aide de YOLO11

Lorsque des modèles de vision tels que YOLO11 sont intégrés à des drones (véhicules aériens sans pilote), ils peuvent être utilisés pour analyser différentes caractéristiques des plantes en temps réel. La capacité de YOLO11 à détecter de petites caractéristiques dans des images aériennes à haute résolution, comme les extrémités des feuilles, aide les chercheurs et les agriculteurs à suivre les stades de développement des plantes avec plus de précision que les méthodes manuelles traditionnelles.

Par exemple, la prise en charge de la détection d'objets par YOLO11 peut être utilisée pour identifier les différences entre les plants de riz tolérants à la sécheresse et les plants de riz sensibles à la sécheresse en comptant le nombre de feuilles visibles. Les indices visuels comme le nombre de feuilles sont souvent corrélés à des caractéristiques plus profondes, telles que la biomasse et la résilience des plantes. 

Détection de fleurs avec YOLO11

La détection et le comptage des fleurs sont des aspects intéressants du phénotypage des plantes, en particulier en ce qui concerne les cultures où la quantité de fleurs est étroitement liée au potentiel de rendement. En particulier, YOLO11 peut être utilisé pour détecter diverses structures florales. En automatisant le processus de détection des fleurs, les agriculteurs et les chercheurs peuvent prendre plus rapidement des décisions fondées sur des données concernant le moment de la pollinisation, l'allocation des ressources et la santé globale des cultures.

Détection des maladies des plantes avec l'IA et YOLO11

La détection des maladies des plantes est un élément crucial de la surveillance de la santé des cultures. Grâce aux capacités de classification d'images de YOLO11, les images des cultures peuvent être classées pour identifier les premiers signes de maladie. YOLO11 peut également être intégré dans des appareils tels que des drones, des applications mobiles ou des robots de terrain pour la détection automatisée des maladies. Cela permet aux agriculteurs de prendre des mesures rapides contre les épidémies, réduisant ainsi les pertes de rendement et minimisant l'utilisation de pesticides.

Par exemple, YOLO11 peut être entraîné sur mesure pour classer les images de feuilles de vigne qui peuvent présenter des signes d'enroulement de la vigne. Le modèle apprend à partir d'exemples étiquetés couvrant différents stades de la maladie, tels que les feuilles saines, la légère décoloration et les symptômes graves. En reconnaissant des motifs visuels distincts comme les changements de couleur et la décoloration des veines, YOLO11 aide les viticulteurs à détecter les infections précocement et à prendre des décisions plus éclairées sur les traitements.

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Fig 4. Exemples de la façon dont la maladie de l'enroulement foliaire de la vigne se manifeste.

Avantages de l'utilisation de YOLO11 pour le phénotypage des plantes

Voici quelques avantages de l'utilisation de modèles de vision par ordinateur comme YOLO11 par rapport aux méthodes traditionnelles de phénotypage des plantes :

  • Évolutivité et rentabilité : L'automatisation des processus avec YOLO11 peut réduire le besoin de main-d'œuvre manuelle, ce qui en fait une solution évolutive et rentable pour les opérations agricoles à grande échelle.
  • Alertes en temps réel : L'intégration des informations collectées à l'aide de YOLO11 avec des systèmes automatisés permet d'envoyer des notifications instantanées sur les problèmes potentiels, ce qui favorise une prise de décision rapide.
  • Pratiques agricoles durables : En réduisant les interventions manuelles et l'utilisation de produits chimiques, la vision par ordinateur contribue à une agriculture plus respectueuse de l'environnement et durable.

Défis de la vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes

Bien que la vision par ordinateur offre de nombreux avantages en matière de phénotypage des plantes, il est important de garder à l'esprit les limitations liées à la mise en œuvre de ces systèmes. Voici quelques préoccupations clés :

  • Exigences relatives aux ensembles de données : La formation des modèles nécessite des ensembles de données vastes, diversifiés et bien étiquetés, ce qui peut être difficile et long à collecter, en particulier pour les cultures rares ou les conditions uniques.
  • Préoccupations en matière de confidentialité : À mesure que les drones et les caméras intelligentes deviennent plus courants dans les champs, des questions se posent quant à savoir à qui appartiennent les données, comment elles sont stockées et si elles sont utilisées sans consentement approprié.
     
  • Conditions environnementales : Les changements d'éclairage, de météo et l'encombrement de l'arrière-plan peuvent affecter la précision de l'analyse visuelle dans des environnements agricoles imprévisibles.

Vers le phénotypage des plantes à haut débit

L'avenir du phénotypage des plantes s'oriente vers des systèmes intelligents et interconnectés qui travaillent ensemble pour donner une image plus claire de la santé et de la croissance des cultures. Une tendance intéressante est l'utilisation simultanée de plusieurs capteurs. En combinant les données provenant de diverses sources, nous pouvons obtenir une compréhension beaucoup plus riche et plus précise de ce qui arrive à une plante.

Les tendances du marché témoignent également d'un intérêt croissant pour les méthodes avancées de phénotypage des plantes. Le marché mondial du phénotypage des plantes est d'environ 311,73 millions de dollars cette année (2025) et devrait atteindre 520,80 millions de dollars d'ici 2030. 

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Fig 5. La valeur marchande du phénotypage des plantes.

Principaux points à retenir

La vision par ordinateur dans le phénotypage des plantes contribue à automatiser la mesure et l'analyse des plantes. Les modèles d'IA de vision tels que YOLO11 peuvent réduire le travail manuel, obtenir de meilleurs résultats et faciliter la surveillance des cultures à grande échelle. Le passage des méthodes traditionnelles aux systèmes intelligents axés sur la technologie représente une étape importante vers la résolution des défis mondiaux tels que le changement climatique, les pénuries alimentaires et l'agriculture durable.

À l'avenir, l'intégration de la vision par ordinateur à d'autres technologies telles que l'IA, la robotique et les capteurs intelligents rendra l'agriculture encore plus intelligente et efficace. Au fur et à mesure que l'IA progresse, nous nous rapprochons d'un avenir où nous pourrons surveiller les plantes de manière transparente, affiner leur croissance et leur fournir les soins nécessaires.

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